Pô, tou com o mesmo problema que você. Sempre fiz agachamento livre, mas com cargas moderadas, entre 50~60kg. Agora tou fazendo o Stronglifts, quando passei dos 70kg adotei sua técnica de apontar um pouco os pés para fora para aliviar a tensão nos joelhos e de uma semana pra cá venho sentindo essas dores na virilha. Confesso que é complicado saber se é muscular ou se é algum tendão ou nervo e como no Stronglifts faço agachamento 3x na semana, fica mais difícil ainda saber. O que você pode fazer pra aliviar é alternar a posição do pé em cada treino (reto ou levemente pra fora) pra não sobrecarregar nenhum músculo e tentar o máximo possível jogar o peso no calcanhar, e não na planta e na ponta do pé. Mesmo quando agachar sem ou com pouco peso, tenta jogar o peso pro calcanhar e você vai ver que já dá uma aliviada.
Boa sorte!